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是敌是友? 酶分辨RNA是否是病毒

(盐湖城)——骰子, 一种生命必需的酶, 将长双链RNA (dsRNA)切割成调节基因表达的短片段. 但在很多方面,dsRNA分子看起来都很相似, Dicer必须做出一些重要的决定:这是一个需要被切割以触发免疫反应的病毒dsRNA吗, 或者是一个友好的dsRNA,需要被切割才能使我自己的细胞正常工作?

在一项使用果蝇(果蝇)的Dicer的研究中,今天在 分子细胞, 犹他大学的研究人员表明,Dicer在dsRNA分子的末端使用了独特的特征, 就像大发娱乐使用人脸一样, 辨别朋友或敌人.

当Dicer遇到两条链在同一位置结束的dsRNA时, 被称为“钝”dsRNA, 它夹住dsRNA,这样它就可以沿着分子的整个长度有效地切割分子,制造许多小的干扰rna, 或siRNAs. 虽然需要进一步的研究来大发娱乐提供证据, 作者推测,这种“过程性”反应可能只适合于切割病毒dsRNA以触发抗病毒反应.

当两条dsRNA链不在同一位置结束时, 还有一条“伸出来”,Dicer的反应不同. 作者表明,当Dicer遇到特定类型的悬垂时, 叫做3'悬挑, 它不会夹紧, 但在每次裂解后都会从dsRNA上脱落. 这种类型的切割是制造小rna所必需的, 哪些对细胞的正常功能很重要.

“了解Dicer可以区分钝和3'悬垂的区别可能只是冰山一角,” 布伦达L. 鲈鱼,Ph值.D.,著名教授,H.A. 和埃德娜·本宁的总统捐赠主席 生物化学 该研究的通讯作者. 事实上, 作为研究的一部分, 该研究的合著者、博士生凯尔·特雷廷(Kyle Trettin)展示了一种名为“健谈- pd”的辅助蛋白,它可以让Dicer识别它通常看不到的末端.

糖蛋白是一种很大的蛋白质,有很多活动的部分. 其中一个部分被称为解旋酶结构域, 作者表明,当Dicer夹住钝的dsRNA时,需要这个结构域来改变它的形状. 大蛋白通常很难过度表达, 或大量生产, 这使得巴斯实验室所做的生物化学研究变得困难.

事实上,过度表达Dicer的问题阻碍了理解Dicer如何工作的进展. 这项新研究的一个关键方面是由博士生和第一作者Niladri K. Sinha, 谁花了18个月的时间仔细优化过表达和蛋白质纯化的每一步. 巴斯推测,辛哈现在比世界上任何人都拥有更多的骰子, 但他们指出,他们的出版物中包含了仔细的协议,以便任何研究人员都能获得大量的Dicer.

了解Dicer如何区分病毒dsRNA和大发娱乐细胞中产生的正常dsRNA,可以让大发娱乐了解当这个过程出错时导致的疾病. “例如, 大发娱乐实验室的其他研究正在解决异常免疫反应的假设, 比如伴随糖尿病和其他疾病的炎症, 当细胞的正常dsRNA被误认为是病毒时,会发生什么,巴斯说.

这项研究是由 H.A. 和埃德娜·本宁协会 犹他大学的教授. Related studies in the lab are funded by National Institutes of Aging of the National Institutes of Health (NIH; 8DP1AG044152), a $2.巴斯在2011年获得了美国国立卫生研究院院长先锋奖. 她是全国13位获得该奖项的科学家之一, 这是美国国立卫生研究院最负盛名的奖项之一.

果蝇Dicer-2的切割是由解旋酶和dsRNA末端依赖状态介导的,这些状态是由loquious - pd调节的; Niladri K. 凯尔·D·辛哈. Trettin P. 约瑟夫·阿鲁斯卡瓦奇,布伦达·L. 低音, 分子细胞 (Epub ahead of print); April 16, 2015